PPI
From Big Data Analytics Lab
Overview
우리 팀에서는 단백질간의 상호작용을 예측하여 이를 데이터베이스로 구축하고 예측된 결과의 해석을 수행하는 것과 관련된 연구를 수행하고 있습니다. 단백질은 대사회로 내에서 다른 단백질과 같이 작용하거나 복잡한 화합물의 구성 요소를 이루는 경우가 많습니다. 따라서 단백질이 어떤 기능을 하는지 알아내려면 단백질간의 상호작용을 이해하는 것이 필요합니다. 시간이 갈수록 밝혀지는 genome sequence의 양은 많아지지만 모든 종들에 대해 실험적으로 그 기능을 알아낼 수는 없습니다. 따라서 전산학적인 방법을 이용해 그 기능을 예측하는 방법들이 등장했고 많은 연구가 이루어지고 있습니다. 연구 분야는 단백질간의 관련성을 알아내는 알고리즘, 관련성을 그래프로 시각화하는 알고리즘, 관련성을 해석하여 기능에 대응시키는 알고리즘 등을 포함합니다. 우리 팀은 OASIS 환경 내에서 단백질 상호작용 데이터베이스를 구축하고 이를 시각화하여 제공하는 컴포넌트를 담당하고 있습니다.