Pathway
From Big Data Analytics Lab
Overview
저희 팀은 Pathway에 대해 연구를 하고 있습니다. 생명체의 대부분의 화학 반응은 효소(enzyme)에 의한 화합물 (substrate)에서 화합물(product)로의 변환이다. 이런 반응 관계를 일반적으로 pathway라 부르며 이 pathway를 이용하여 유전자가 어떤 경로 상에서 다른 어떤 유전자와 관계하고 있는지 혹은 그 유전자의 역할이 무엇인지를 지도나 표로부터 찾을 수 있게 된다. Pathway 데이터베이스는 세포의 다양한 처리 과정에 연관되는 분자의 경로와 화합물에 대한 다이어그램 정보를 포함한다. pathway는 물질 처리 과정과 에너지 변환 과정 등의 분석과 비교를 하는데 있어 중요성을 가지게 된다. 특히 유전자 분석에 활발히 이용이 되고 있다. Pathway의 주요 관심 분야를 보면 최초 화합물에서부터 최종 화합물까지의 경로분석이 주요 관심대상이며 각각의 pathway를 사용자에게 의미있게 시각화하는지도 중요한 이슈이다. 또한 GO와 같이 MicroArray분석에 있어서 상당히 중요한 분석도구로 사용되고 있다. 저희 팀에서는 이런 pathway 데이터를 RDF로 변환하여 사용하며 pathway의 경로 질의, Visualization 같은 연구를 수행하고 있습니다.